La capacidad de canalizar energía universal es transmitida por los Maestros de Reiki mediante sintonizaciones o iniciaciones (tres niveles y Maestría) que representan la apertura de los canales energéticos del alumno para hacer posible la transmisión de la energía Reiki.

El proceso de iniciación se hace necesario pues, en su origen, el hombre mantenía sus canales de energía intactos, generando felicidad y armonía.  Con el proceso de olvido de nuestro origen (desconexión con la Fuente), ante la individualización extrema y la evolución de los sentimientos de egoísmo y orgullo, estrechamos estos canales de comunicación, dejamos de usarlos y terminamos no recibiendo toda la energía necesaria para nuestros bien vivir.  Llegamos a retener solamente la energía indispensable al sustento de nuestro proceso bioquímico para la supervivencia.

La iniciación es una ceremonia sagrada, y el contacto se restablece a través del maestro que lo habilita como canal de energía.  Un verdadero maestro de Reiki recibe una serie de transmisiones de energía y se encuentra apto para activar, aplicar y enseñar a los demás.  El maestro de Reiki no ejerce poder sobre sus estudiantes; es, simplemente, alguien que escogió aceptar la gran responsabilidad de transmitir a los interesados el conocimiento que adquirió en su destino.

Mikao Usui redescubrió el modo de volvernos a “religar” a la energía vital del Universo.  “Religare” , ese proceso al cual se dio primeramente el nombre de iniciación, es hoy denominado proceso de ajuste, sintonización o afinación, indicando que la persona está sintonizada con el Reiki, a semejanza de la sintonización que se lleva a cabo en una radio o televisor, a una determinada frecuencia o estación.  Podemos, también, denominar armonización a ese procesos, por el hecho de ser un poderoso vehículo de conciliación de todos nuestros cuerpos.

En el proceso de iniciación, todos los canales de fuerza del cuerpo, responsables de la captación y distribución de nuestra energía, son reactivados para funcionar dentro de los moldes originales, proporcionando el poder de curar y armonizar, no solamente a nosotros mismos, sino también a todos los que tocamos.  Una vez realizada la iniciación, ese canal de energía permanecerá abierto toda la vida, evitando que haya participación y desgaste de energías personales en los tratamientos.  Con la iniciación, las manos irradian vibraciones que fluyen a partir de la cabeza, cuado entran en contacto con zonas en desarmoía.  Las manos están aptas para curar enfermedades agudas y crónicas.

Ese proceso es complementado a través de la utilización de mantras (sonidos) y yantras (formas) que tienen el poder de potenciar la energía y romper las limitaciones de tiempo y espacio.

La iniciación es una activación de los centros energéticos superiores (chakras), haciendo que nuestra vibración y frecuencia aumenten y se transformen, pasando a niveles más elevados.  Ese proceso incluye el nivel de la conciencia, y produce indefectiblemente, una gran transformación que impulsa a nuestro centro a subir desde el plexo solar hacia el chakra del corazón.
La sintonización del Nivel I se centra, principalmente, en la apertura del cuerpo físico para que sea receptivo a la gran cantidad de energía vital que va a recibir.  Las 4 sintonizaciones que realiza el maestro en el nivel I elevan la frecuencia vibratoria de los cuatro centros de la parte superior del cuerpo humano (chakras).
La primera iniciación armoniza el corazón y la glándula timo, al mismo tiempo que sintoniza el chakra del corazón con el cuerpo etérico.
La segunda armonizción afecta la glándula tiroides y, en el campo etérico, ayuda a abrir el chakra de la garganta, que es nuestro centro de comunicación.  La tercera iniciación afecta el llamado tercer ojo, que corresponde a la glándula pituitaria, nuestro centro de alta intuición y conciencia, y el hipotálamo, que actúa en el control y temperatura del cuerpo.
La cuarta armonización aumenta la apertura del chakra coronario, nuestra comunicación con la conciencia espiritual, que corresponde a la glándula pineal.  Esa sincronización final completa el proceso, sellando el canal abierto, de tal modo que pueda mantenerse abierto por el resto de la vida, aun cuando no lo usemos durante un largo periodo de tiempo: entretando, en el momento en que decidamos usarlo, estará a nuestra disposición.  Durante el proceso de iniciación, la persona que está siendo activada podrá experimentar una serie de sensaciones, tales como: sentir mucha paz y armonía, un calor agradable, una profunda relajación, calor en las manos, tristeza profunda, llanto o amor.  La persona también podrá visualiar maestros, ver luces, ver colores (azul celeste, violeta, dorado..) o incluso proyectarse en el pasado.
Para recibir la iniciación de Nivel II, que te convierte en un sanador más completo (al tratar de manera distinta las dolencias físicas y los problemas mentales o emocionales), y que permite enviar energía a distancia, es necesario haber recibido la iniciación de Nivel I. Iniciándose en Nivel II pueden darse tratamientos más eficaces.
Mientras que el Nivel I es el de practicante que únicamente se aplica Energía Universal a sí mismo y  a las personas más cercanas, una vez realizado el curso de Nivel II y, habiéndolo practicado durante un tiempo, se puede ayudar a los demás como sanador o terapeuta Reiki.
Con el Nivel III comienza la preparación para la Maestría y con el grado de MAESTRO DE REIKI debes responsabilizarte especialmente de tu evolución personal, al tiempo que adquieres un compromiso con la práctica y la difusión de Reiki, "honrando el linaje espiritual de Usui Sensei".
Una vez realizada la ceremonia de iniciación del estudiante por un Maestro, el practicante de Reiki canaliza a voluntad la energía a través de sus manos, incluso desde el primero de los niveles.
Después de recibir la iniciación del Maestro de Reiki, la capacidad de canalizar energía universal permanece para siempre.
La iniciación permite aplicarse Reiki a uno mismo y a los demás.